【土地资源】綦江区地处云贵高原与四川盆地接合部，素称“重庆南大门”，东连南川，南接贵州习水、桐梓两县，西连江津，北靠巴南，其中，万盛经开区位于綦江区东部。全区地势南高北低，有中山、低山、深丘、浅丘和槽谷五大类地形，而以低山丘陵为主，山地占全区总面积的67.6%，丘陵占32.4%。最高峰为紧邻贵州省桐梓县新站的石壕镇老鹰岩（海拔1848米），最低点为永新镇升平木瓜溪口（海拔188米）， 1660米的海拔高差，参差错落的地形，有如一个放大的盆景。全区土地面积218568.43公顷，其中耕地面积64453.93公顷，园地面积4227.52公顷，林地面积111550.5公顷，草地面积423.17公顷，城镇村及工矿用地16899.79公顷，交通运输用地2178.76公顷，水工建筑用地163.01 公顷，水域用地 4565.55公顷，湿地 73.74公顷，其他土地14032.46公顷。

【森林资源】全区林木以针叶树、阔叶树为主。针叶树有8个科、19个属、34个种，主要有马尾松、杉树、柏树、柳杉、侧柏；阔叶树有103个科、400个属、1034个种，主要有壳斗科青冈类（包括短柄枹栎、麻栎、青冈）枫香、丝栗、喜树、香樟、楠木、杨树、苦楝、刺槐、桉树等；竹类主要有楠竹、慈竹、水竹、斑竹、刺竹、方竹、白夹竹、苦竹、硬头黄等。全区发现国家重点保护树种有：秒椤、银杏、红豆杉、楠木、香樟、铁树、喜树、厚朴、润楠、水杉、福建柏、南川木波罗、仁豆树、红豆杉、鹅掌楸等，其中红豆杉、银杏、水杉为国家一级保护植物。东溪镇发现的南川木波罗2004年被《中国物种红色名录》定为“极危”树种，为中国特有、珍稀植物之一。全区古树共531株，涉及19个乡镇、1个林场。古树中一级古树1株、二级古树47株、三级古树483株。

【动物资源】全区野生动物有100多种，其中：兽类20余种、鸟类40余种、蛇虫类50余种。重点保护野生动物有黑叶猴、云豹、林麝(shè)、猕猴、穿山甲、豺(chái)、青鼹(yǎn)、大灵猫、小灵猫、果子狸等10余种。按保护级别，一级保护野生动物有黑叶猴、云豹、穿山甲、林麝(shè)、大灵猫、小灵猫等。二级保护野生动物有猕猴、画眉等。其中，种类分布较多的有野猪、猕猴、果子狸、松鼠等。

【植物资源】綦江区有2000多种植物资源，其中栽培植物近1000种。粮食作物以水稻、小麦、玉米、薯类为主，其次是豆类等小杂粮；经济作物有桑、果、茶、橘子、木瓜、红梅、银花、吴英、杜仲、黄檗等110多个长经品种，有油菜、烟叶、海椒、花生、西瓜、甘蔗等450多个短经品种。綦江是全国商品粮基地区、重庆市烟叶生产和蚕桑生产基地。特色农产品有綦江木瓜、东溪辣椒、赶水草蔸萝卜、横山大米、石壕糯玉米、东溪花生、东溪米黄瓜、风岩沟大米、石角花椒、永新梨子等。

【矿产资源】綦江区矿产资源丰富，全区已发现矿产资源20种：煤、煤层气、天然气、页岩气、铁、铜、硫铁矿、石膏、萤石、方解石、水泥用灰岩、建筑石料用灰岩、玻璃用砂岩、建筑用砂岩、砖瓦用页岩、耐火黏土、饰面用灰岩、含钾岩石、地热、矿泉水。优势矿产为煤、页岩气和石灰岩等。綦江区南部四镇设置3个集中开采区，潜在资源约22亿吨。已勘查评价矿床已勘查评价矿床40处，其中大型矿床7处，中型矿床7处，小型矿床26处。已调查评价矿区36个。其中煤炭资源量13.68亿吨、铁矿资源量0.9亿吨、石灰岩资源量19.48亿吨。

【水资源】綦江区境内水资源丰富，较大的河流有綦江河、藻渡河、羊渡河等。多年平均降雨量1048.8毫米，年内降雨多集中在5—10月，约占全年的76%—80%。多年平均水资源总量为10.38亿立方米。2023年降水量 1077.3毫米，2023年水资源总量为9.77亿立方米，其中地表水资源量 9.77亿立方米，地下水资源量1.78亿立方米，地下水资源量是地表水资源量的重复计算量。总供用水量为1.6195亿立方米。